锦州市中医医院前身是锦州市中医研究院，初建于1958年，1979年正式成立锦州市中医医院。负责锦州百姓的中医治疗、保健及城南新区的急诊急救、基本医疗需求。是一所集医疗、教学、科研、预防保健、急诊急救五位一体的以中西医融合为主体、以中医中药为重点、以康复治疗为特色的综合性三级甲等中医医院，并于2006年11月挂牌为锦州市第三医院。医院是锦州市职工医疗保险、城乡居民医疗保险、铁路医疗保险、工伤医疗保险的定点单位和锦州市四个县（市）医保转诊定点医院。是锦州市道路交通事故伤者定点救治医院。是辽宁中医药大学附属医院医联体医院。是北京中医药大学社会实践基地；辽宁中医药大学和辽宁医药职业学院教学医院和就业基地；锦州医科大学教学医院及康复治疗、社区实践教学基地；江西中医药高等专科学校和锦州市卫生学校实习基地。是锦州市中医医疗、中医护理、中药药事的质控中心。
医院占地面积2.2万平方米，建筑面积3.3万平方米。开放床位410张，职工442人，专业技术人员412人，其中卫生技术人员378人，高级职称67人，中级职称96人。硕士研究生导师2人，硕士研究生29人。省级名中医1人，市级特色医生1人，“省百千万人才工程”百人层次1人。医院设有26个临床科室，10个医技科室。
其中，康复中心是国家中医药管理局“十二五”重点专科培育项目单位、锦州市临床医学重点专科；脑病科是辽宁省“十二五”中医重点专科，针灸科、软伤科、糖尿病科是辽宁省“十三五”中医重点专科；内科和结石科是锦州市临床医学特色专科，软伤科是锦州市中医软伤治疗中心。
医院科室门类齐全，技术力量雄厚，设备先进，包括CT、DR、罗氏全自动生化分析仪、罗氏电化学发光免疫分析仪、迈瑞DC-8彩色超声多普勒、德国JOIMAX椎间孔镜微创系统、体外冲击波碎石机（ESWL-Ⅴ型）、德国狼牌膀胱、输尿管肾硬镜、经皮肾镜、德国STORZ电子输尿管肾软镜和气压弹道碎石机、钬激光治疗机、瑞典金宝血液透析机、神经功能重建系统、多功能康复评估训练平台、语言康复训练系统、认知康复诊疗系统、脑病康复治疗仪等百余台先进的大型检测、诊断、治疗仪器设备，为医疗工作提供了强有力的保障。