成都市疾病预防控制中心成立于2002年3月28日，由原成都市卫生防疫站、成都市第二卫生防疫站和成都市健康教育所优化组建而成，是市政府举办的公益一类事业单位，四川省三级甲等疾控机构，是对重大污染、重大中毒、重大疫情、重大灾害等突发事件实行危机管理的技术中心，是全市疾病预防控制、健康教育、健康促进的业务指导中心，挂成都市预防医学研究院牌子，是美国乔治亚州立大学、清华大学万科公共卫生与健康学院、四川大学华西公共卫生学院、华中科技大学同济医学院、中国疾控中心研究生院等国内外高校、科研院所教学实践基地，与中国医学科学院共建成都新发突发传染病防治工作站。
中心承担七项基本职能：疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术管理与应用研究指导。
中心在职职工361人，其中专业技术人员322人。拥有四川省政府学术技术带头人1人、后备人选4人，“天府万人计划”天府名医1人，四川省卫生健康首席专家1人，四川省卫生计生领军人才1人，四川省卫生厅学术技术带头人2人、后备人选3人，四川省卫生厅有突出贡献中青年专家1人，享受国家及市政府特殊津贴专家1人，成都市卫生计生系统学术技术带头人1人、后备人选2人。四川省司法厅批准的司法鉴定人3人，实验室国家认可（CNAS）评审员2人，国家级食品检验机构资质认定评审员2人。
中心占地面积19511.13平方米，建筑面积29882.13平方米。中心现设26个科室，其中业务科室19个、职能科室7个。建成理化省级医学重点实验室，国家流感网络实验室，国家食品风险监测实验室，艾滋病确证实验室等。现有2个省级重点学科，3个市级重点学科。
2022年，中心获得荣誉称号80项，其中集体荣誉28项，个人荣誉52项。中心被全国爱国卫生运动委员会评为爱国卫生运动70周年先进集体，代表国家接受WHO的NRA评估荣获疫苗国家监管体系评估工作先进集体，被市委市政府评为成都建设全面体现新发展理念的城市改革创新先进集体以及“07.15”疫情以来无私奉献、担当作为的先进集体，被市卫健委评为市卫健系统“2.20”疫情处置工作表现突出的先进集体。