重庆医科大学附属永川医院创建于1939年，2009年成建制划转重庆医科大学，是一所集医疗、急救、预防保健、康复、教学和科研为一体的国家三级甲等综合性医大附属医院。是国家卫生健康委员会认定的国际紧急救援中心网络医院、重庆市规划的区域性医疗中心、重庆市医疗急救中心永川分中心、重庆市新冠肺炎确诊患者集中救治定点医院、医保跨省异地就医联网即时结算定点医疗机构。是国家卫生健康委住院医师规范化培训基地、临床药师规范化培训基地、国家药物临床试验机构、中国胸痛中心、国家高级卒中中心、中国房颤中心、重庆市老年疾病临床医学研究中心、重庆市护士规范化培训基地、重庆市医师资格实践技能考试基地、重庆市首批住院医师规范化培训结业考核技能考核基地。2018年成功创建成为重庆市智慧医院，2020年成为互联网医院。医疗服务辐射永川及周边地区约1000万人口。
医院建立于1939年（璧山县人民医院），1943年更名为四川省第三区督察专员公署中心卫生院，1946年更名为四川省国立璧山医院，1950年更名为璧山专区中心医院，1951年更名为川东江津专区人民医院，1981年更名为永川地区人民医院，1983年更名为重庆市第二人民医院，2009年成建制整体划转重庆医科大学，成为重庆医科大学附属永川医院（重庆市第二人民医院、重医第五临床学院）。2020年获批成为重庆医科大学全科医学院、护理学院永川分院。
医院分为萱花院区、兴龙湖院区、渝西区域公共卫生应急医院三部分。其中萱花院区占地96亩，包括教学部和医疗部，医疗用房11万平方米，编制床位1500张。兴龙湖院区占地174亩，正在建设中，其中医疗用房约16万平方米，编制床位1200张，教学用房6万多平方米，可容纳2000-3000名学生。渝西区域公共卫生应急医院300张固定编制床位，预留700张临时床位。
医院设有47个临床医技科室，拥有省部级重点学科1个（全科医学科）、省部级医学重点学科1个（全科医学科）、省部级重点实验室1个（脑血管病研究实验室）、省部级临床重点专科5个（神经外科、神经内科、儿科、呼吸内科、肿瘤内科），省部级特色专科2个（骨科、呼吸与危重症医学科），是重庆市区域颈椎病临床诊疗中心，重庆市博士后科研工作站、重庆医科大学临床医学博士后科研流动站。医院全面开展院内学科建设，临床重点建设专科10个（心血管内科、普通外科等）、特色医疗专科15个（烧伤、消化、核医学等）。
医院全科医学为重庆市市级质控中心，有妇科、医学影像、病案管理、血液、神经内科、耳鼻咽喉等6个市级质控中心渝西分中心，有感染管理、神经外科、耳鼻咽喉头颈外科、全科、眼科、呼吸内科、健康体检、护理、重症医学、急诊医学等19个永川区级质控中心。
2022年医院门诊82.5万人次，出院患者5.1万人次，住院手术1.5万台次，总资产18.99亿元，净资产14.82亿元。院共有在职职工2324人，其中专业技术人员1947人（含住培237人、护培137人），劳务派遣250人，博士硕士研究生424人，高级专业技术人员达222人，中级424人，教授副教授76人，博导、硕导117人，专任教师340人，离退休职工412人。
医院配有256层、64层、63层CT各1台、1.5T和3.0T核磁共振成像系统各1台、双光子直线加速器、SPECT/CT、“飞秒”激光系统、四维和高端心脏超声诊断仪、移动式C形臂X射线机、DSA血管机、高清胃肠镜和腹腔镜系统、海扶刀等先进诊疗设备。
医院坚持以一流的技术求发展，走科教兴院之路。成功开展了体外循环下各类心脏手术、急性脑梗死经皮血管腔内溶栓术和机械取栓术、颅内动脉瘤介入栓塞及夹闭术、经颈静脉肝内门体分流术、经皮冠状动脉介入治疗、经气管镜介入治疗技术、（体外肺膜氧合）ECMO、神经内镜治疗技术、高强度聚焦超声消融子宫腺肌病（HIFU）、肺部肿瘤热消融技术、经导管主动脉瓣植入术（TAVI）、零射线房颤导管消融术、浮针疗法等高精尖及特色技术。
作为重庆医科大学第五临床学院、全科医学院、护理学院永川分院，目前已构建起院校医学教育（含本科、硕士研究生及博士研究生）、毕业后医学教育、继续医学教育的完整医学教育体系，取得高校教师资格证的人员382人。承办专业为临床医学（农村订单定向）、眼视光医学、护理学（专升本）专业，同时承担学校预防医学专业、生物医学工程专业的临床课程理论及实习教学及其它院校学生的实习教学。现所辖本科学生700余人，全日制硕士、博士研究生170余人。作为国家卫生健康委住院医师和临床药师规培基地，重庆市护士规范化培训基地，我院现开展住院医师、护士规范化培训，全科医生转岗培训，临床实践技能培训，以及国家级和省部级继续医学教育项目，现有各类培训学员400余人。
建立服务于医疗业务、患者服务、运营管理一体化信息系统，支撑医院高质量发展。2018年通过重庆市卫健委智慧医院四级评审，2019年通过国家卫健委电子病历系统应用水平四级评审，2020年通过国家医疗健康信息互联互通标准化成熟度四级甲等的测评。2020年取得互联网医院执照。
“十四五”时期是医院巩固“十三五”建设成果，全面开启现代化建设新征程、推动高质量发展的第一个五年，是转变发展方式、优化治理结构、转换增长动能的关键时期。医院构建“1个目标、8大重点工程、40个重点项目”的“十四五”发展战略规划体系，即以“建成渝西地区及周边具有较大辐射引领作用的国家医学中心副中心、省级区域医疗中心，基本实现医教研协同、产学研用一体化发展格局”为目标，以“党建引领文化、学科建设攀峰、医疗服务提升、医学人才培养、科研成果转化、优质人才引育、医院管理精益、智慧医院建设”八大工程为抓手，推动建设40个重点项目，持续提升医教研管综合水平，实现医院高质量发展。